「C05-004 破滅の切先ズィーガー」がバトルで相手のゼクスを破壊した時、チャージのカードを２枚トラッシュに置くことで、ノーマルスクエアのゼクス２枚破壊できますか。

いいえ、できません。「C05-004 破滅の切先ズィーガー」の自動能力はバトルで相手のゼクスを破壊した時に１度だけ使うことができます。